Identificarea și analiza întregului genom a familiei de gene esterase carbohidrați la Colletotrichum graminicola

Colletotrichum graminicola poate cauza apariția petelor pe frunze și putrezirea tulpinilor la porumb.

Funcția principală a esterazelor de carbohidrați (CE) este de a elimina modificările esterice din monozaharide, oligozaharide și polizaharide, facilitând astfel hidroliza zaharurilor.

În acest studiu, am identificat 128 de gene CE prin analiza întregului genom și adnotare funcțională a speciei C.

graminicola TZ–3.

De asemenea, am analizat proprietățile fizico-chimice, localizarea subcelulară, motifurile conservate, structurile genice și elementele de reglare a promotorilor acestor 128 de gene CE (CgCE) din C.

graminicola.

Rezultatele noastre au arătat că jumătate dintre proteinele CgCE se aflau în mod extracelular.

Proteinele CgCE au demonstrat o diversitate atât în structuri, cât și în motifuri.

În plus, familia de gene CgCE conține numeroare domenii conservate, sugerând o diversitate funcțională potențială.

Elementele de reglare asociate cu diverse stresuri și hormoni vegetali au fost identificate în acest studiu.

Analiza îmbogățirii în termeni GO și a modelelor de expresie a indicat că genele CgCE sunt implicate în procese metabolice și pot contribui la stabilirea infecțiilor fungice și la extinderea leziunilor.

Aceste rezultate îmbogățesc înțelegerea familiei de gene CE din C.

graminicola și oferă o bază pentru investigații ulterioare asupra rolului lor în patogenitatea fungală..